目的 探讨云南西双版纳地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型和基因亚型分布情况.方法 选取2012年5月至2013年4月西双版纳地区汉族和人数最多的两个少数民族(傣族和哈尼族)人群为研究对象,采用巢式PCR、基因序列测定等技术获取HBV全基因组序列后,构建系统进化树并计算遗传距离鉴定HBV基因型和基因亚型.结果 在此地区人群中共检出3种HBV基因型:B基因型139例(76.0％),其中以B2亚型为主(105例,57.4％),quasi B3亚型次之(34例,18.6％);C基因型41例(22.4％),主要为C1亚型(33例,18.0％),其次为C2(4例,2.2％)和C5(4例,2.2％)亚型;I基因型3例(1.6％).三民族人群HBV基因型与基因亚型分布比较:哈尼族人群HBV基因型分布与其他两个民族显著不同(哈尼族vs汉族:χ2=8.416,P=0.006;哈尼族vs傣族:χ2=15.636,P<0.001),其B基因型显著高于其他两个民族,同时没有发现I基因型;三民族人群HBV基因亚型组成也显著不同(汉族vs傣族:χ2=33.598,P<0.001;汉族vs哈尼族:χ2=22.102,P<0.001;哈尼族vs傣族:χ2=16.129,P=0.001),quasi B3亚型仅存在于傣族和哈尼族等少数民族人群,汉族人群中未检出;傣族C1亚型较其他两个民族人群高,且C5仅在傣族人群中发现;哈尼族人群C基因亚型全部为C1亚型.结论 此地区HBV基因型和基因亚型分布复杂且不同民族人群HBV基因型和基因亚型分布具有民族的自身特点.