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云南大理某农村猪星状病毒分子流行病学调查

Molecular epidemiology of porcine astrovirus in rural area of Dali City, Yunnan Province, China

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ CSCD-E

机构: [1]云南昆明理工大学医学院,云南昆明650500 [2]云南省第一人民医院生殖妇科,云南昆明650032
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关键词: 猪星状病毒 逆转录巢式聚合酶链反应 流行病学

摘要:
目的 了解云南大理某农村猪群中星状病毒(astrovirus,AstV)感染情况,为AstV的防控提供理论依据.方法 利用逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nested PCR)技术,对云南大理某农村采集的42份猪粪便样品进行PAstV799 bp基因部分片段扩增、克隆,并测序;利用NCBI BLAST进行数据库比对,Mega 4.1软件进行序列同源性比较和系统进化树构建.结果 Trizol试剂提取42份猪粪便样品上清总RNA,经RT-nested PCR扩增,5份样品可见799 bp的目的基因片段,阳性率为11.90%;PAstV 799 bp片段同源性分析显示,5个毒株与PAstV-1、2、3、4和5的同源性为46.3% ~ 87.9%,与PAstV-4的同源性最高,为75.5% ~ 87.9%;PAstV 799 bp片段的系统进化分析显示,分离的毒株属于PAstV-4,同源性为80.0%~ 99.5%.结论 云南省PAstV-4流行病学调查将有利于中国AstV的预防及治疗.

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第一作者:
第一作者机构: [1]云南昆明理工大学医学院,云南昆明650500 [2]云南省第一人民医院生殖妇科,云南昆明650032
通讯作者:
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资源点击量:82472 今日访问量:0 总访问量:681 更新日期:2025-01-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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