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摘要:
本发明涉及一种利用对高通量测序数据分析预测α珠蛋白基因三联体的方法,属于基因检测技术领域,本发明通过收集多个样本,并对多个样本通过高通量测序,获取α珠蛋白基因HBA1和HBA2这两个基因非同源区域的读本计数reads A1和A2,计算A2/A1比值;通过对A2/A1比值数据分析,发现该数据呈正态分布,进而对A2/A1比值数据做直方图,并结合正态分布数据分布规律,对大于u+2σ区域内的数据认定为异常数据,并判定异常数据对应的样本中存在α珠蛋白基因三联体。在后续检测样本检验中,可以直接根据A2/A1比值判定检测样本中是否存在α珠蛋白基因三联体,本发明的方法经与聚合酶链式反应法验证对比,本发明的判定结果与聚合酶链式反应法结果一致,说明本发明的方法可以直接用来判断α珠蛋白基因三联体的存在。
主权项:
1.一种利用高通量测序数据分析预测α珠蛋白基因三联体的方法,其特征在于,提取检测样本DNA,对检测样本高通量测序,获取各样本HBA1、HBA2的目标基因片段,并获取检测样本中α珠蛋白基因HBA1和HBA2这两个基因非同源区域的读本计数reads,分别记为A1、A2,计算A2/A1比值,当检测样本的A2/A1比值大于0.8,判定检测样本中存在α珠蛋白基因三联体;当检测样本的A2/A1比值小于0.8,判定检测样本中不存在α珠蛋白基因三联体。