目的 分析我国城市卫生资源配置效率的时空差异及其影响因素，为优化城市卫生资源配置提供科学参考。方法基于2012—2021年我国35个大中城市面板数据，采用超效率SBM模型对我国城市卫生资源配置效率进行测算，在此基础上运用核密度估计和Dagum基尼系数进行时空差异分析，并通过Tobit模型检验内外部因素对卫生资源配置效率的影响。结果 2012—2021年，我国城市卫生资源配置效率均值为0.866，存在明显的区域差异，超变密度差异（40.7%）是区域差异的主要来源；政府卫生支出（β=-0.071, P＜0.01）以及每千人医疗机构床位数（β=-0.029, P＜0.05）为我国城市卫生资源配置效率的影响因素，人均GDP、城镇化率、政府卫生支出、每千人卫生技术人员数、每千人医疗机构床位数以及医护比均有显著的地区异质性（P＜0.05）。结论 优化城市卫生资源配置，缩小东中西部区域差异，促进卫生资源配置的经济能动性，强化政府投入保障提升。