目的 本研究旨在利用高通量测序技术,分析下呼吸道肺泡灌洗液(BALF)中的微生物群落结构,特别关注金黄色葡萄球菌的丰度和分布情况。方法 收集云南省第一人民医院2022—2023年间的1 650例BALF样本,通过BALF培养和恒温扩增与微流控技术进行金黄色葡萄球菌基因检测,并将代表性21例金黄色葡萄球菌阳性样本进行分组:金黄色葡萄球菌肺炎组、新冠病毒共感染组、慢性阻塞性肺病组,并进行16S rDNA扩增子高通量测序。结果 三个组别的微生物群落组成存在显著差异,种水平的样本层级聚类分析图显示金黄色葡萄球菌肺炎组金黄色葡萄球菌检出多且占比高,慢性阻塞性肺病组以无色杆菌居多,而新冠病毒共感染组则以水甲基杆菌和无色杆菌为主要的构成对象,三组中只有在金黄色葡萄球菌肺炎组金黄色葡萄球菌居优势菌。结论 BALF微生物群落的组成与不同疾病状态密切相关,为深入了解肺部感染性疾病的微生物学基础提供参考依据。