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文章类型:
机构:
[1]云南中医药大学第一临床医学院
[2]云南省第一人民医院骨科
外科片
骨科
云南省第一人民医院
[3]昆明理工大学医学院
出处:
ISSN:
关键词:
骨关节炎
生物信息学
自噬
中药预测
摘要:
目的:探索骨关节炎(osteoarthritis, OA)自噬特征基因及关联中药预测,为OA自噬机制及临床诊疗提供更多参考。方法:将GEO数据库获取OA相关差异表达基因与自噬基因库HADb获取的基因进行交集,获得OA的自噬基因。GO和KEGG分析生物学功能和通路,并筛选OA自噬核心基因,在验证集中评估诊断效能,最终进行中药预测。结结果果:GO和KEGG分析发现OA的自噬基因涉及泛素蛋白连接酶结合、泛素样蛋白连接酶结合等多生物学功能和细胞凋亡、FoxO信号通路等多通路,筛选并验证了HSP90AB1、BCL2L1、HSPA5、EGFR和MAP1LC3B共5个基因是OA自噬相关的核心基因(P(0.001),综合诊断分析得到AUC值为0.900,且预测得到121味中药,其中清热解毒药、活血祛瘀药类中药占比最大。结论:HSP90AB1、BCL2L1、HSPA5、EGFR和MAP1LC3B可能是OA的自噬诊断基因,预测中药也与临床用药有一致性,表明诊断标志物可靠,为OA的精准医疗提供新的策略和方向。
基金:
云南省骨科与运动康复临床医学研究中心课题项目(2022YJZX-GK10);昆明理工大学医学联合专项(KUST-KH20222054);云南
省科技厅基础研究计划(202301AY070001-214)
第一作者:
第一作者机构:
[1]云南中医药大学第一临床医学院
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
宋玉琼,谢旭华,毛宇翔,等.基于生物信息学探索骨关节炎自噬特征基因及关联中药预测[J].中国民族医药杂志.2025,31(07):26-30.