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◇ 统计源期刊
文章类型：
机构：
[1]昆明医学院附属昆华医院,云南省第一人民医院,普外一科,云南,昆明,650032
外科片
普外一科
昆明医科大学附属第一医院
云南省第一人民医院
[2]昆明市第一人民医院,检验科,云南,昆明,650011
出处：
ISSN：
关键词：
结直肠肿瘤
粪便
细菌
实时荧光定量PCR
摘要：
目的:比较结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的优缺点及获得DNA的质与量.方法:以粪肠球菌作为试验菌株,分别采用标准菌株法、PCR扩增产物纯化法和PCR扩增目的片段割胶纯化法制备标准品,比较三者用于细菌实时荧光定量PCR标准曲线制作的好坏及用核酸蛋白检测仪Biophotmeter测定获得DNA的质与量.并将PCR扩增产物纯化法得到的产物进行测序.结果:PCR扩增目的片段割胶纯化法获得DNA的量及纯度均较低,为29.9±3.2和2.8±0.2,标准菌株法和PCR扩增产物纯化法的量及纯度均较高,分别为62.9±2.7及1.7±0.1,59.1±2.7及1.8±0.1;PCR扩增目的片段割胶纯化法与标准菌株法和PCR扩增产物纯化法相比,差异有统计学意义(P<0.05),标准菌株法和PCR扩增产物纯化法相比,差异无统计学意义(P>0.05),但以标准菌株法为佳.采用标准菌株法及PCR扩增产物纯化法,能获得很好的标准曲线(r=-1.00).并且纯化产物序列与目的片段序列完全相同.结论:标准菌株法及PCR扩增产物纯化法制备标准品作荧光定量PCR检测比PCR扩增目的片段割胶纯化法更适合肠道相关分子微生态的研究.
基金：
云南省应用基础研究项目(2005C0074M%2008ZC085M)
第一作者：
第一作者机构：
[1]昆明医学院附属昆华医院,云南省第一人民医院,普外一科,云南,昆明,650032
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
郭世奎,包维民,龚昆梅,等.结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的比较研究[J].中国现代普通外科进展.2009,12(11):939-942.
