资源类型：
收录情况：
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-E
文章类型：
机构：
[1]昆明理工大学生命科学与技术学院信号传导实验室,昆明650200
[2]云南省第一人民医院胸外科,昆明650032
外科片
胸外科
云南省第一人民医院
出处：
ISSN：
关键词：
肺肿瘤
转录组测序
差异表达基因
细胞增殖
细胞黏附
摘要：
目的应用RNA-Seq技术分析肺癌与癌旁组织的差异基因表达,寻找与肺癌发病相关的基因,探讨肺癌的发病机制。方法对5例ⅡA期肺癌及癌旁组织进行转录组测序,获得差异表达基因集,采用qRT-PCR法检测10例肺癌(对照组)及癌旁组织中的6个关键基因(TFPI2、DKK1、CX3CL1、PSCA、DUOXA2、VSIG1)进行验证。结果ⅡA期肺癌与癌旁组织共有123个差异表达基因,其中上调基因35个(28.5%),下调基因88个(71.5%)。qRT-PCR结果表明,与细胞增殖、凋亡和黏附相关基因TFPI2、DKK1、CX3CL1表达上调,PSCA、DUOXA2、VSIG1表达下调,该检测与RNASeq检测结果一致。结论ⅡA期肺癌与癌旁组织中共有123个差异表达基因,细胞增殖、凋亡、黏附和代谢相关基因参与肺癌的发生、发展,为肺癌的发病机制提供参考。
基金：
国家自然科学基金(81560455、81460417、81460253)；
第一作者：
第一作者机构：
[1]昆明理工大学生命科学与技术学院信号传导实验室,昆明650200
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
杨泽平,曾红,杨洋,等.应用RNA-seq技术检测肺癌与癌旁组织差异表达基因分析[J].临床与实验病理学杂志.2019,35(07):852-855.
