目的了解手足口病重症病例的患病情况、病原构成以及危险因素。方法对2015年11月1日至2016年11月30日全国手足口病监测试点网络直报系统报告的1 489例手足口病重症及死亡病例进行研究,对基本信息、就诊及治疗情况、临床严重程度及病原构成进行描述性分析并通过多项logistic逐步回归分析重症病例治疗结果的危险因素。结果 1 489例重症病例中有7例死亡病例。960例（72.9%）年龄<3岁,937例（62.9%）为男性,病例大部分居住于农村（63.9%）。494例（33.2%）患者首次就诊时选择村级和乡镇级机构。重症病例的发病-就诊、发病-诊断为手足口病和发病-重症诊断的时间间隔分别为0（01）d、1（02）d和2（14）d。并发症有无菌性脑膜炎（51.9%,773例）、非脑干脑炎（25.3%,377例）、脑干脑炎（17.5%,260例）、脑脊髓炎（0.4%,6例）、急性弛缓性麻痹（0.1%,1例）、肺水肿/肺出血（0.3%,4例）和心肺功能衰竭（4.6%,68例）。1 217例纳入病原分析的重症及死亡病例的病原构成依次为肠道病毒（EV）71（52.8%,642例）、其他肠道病毒（21.5%,261例）、柯萨奇病毒（Cox）A16（3.0%,36例）、EV71和Cox A16合并感染（0.1%,1例）。并发症（Z=3.15,P=0.002）和发病-重症诊断的时间（Z=3.95,P<0.001）为治疗结果的危险因素。结论手足口病重症病例以农村男童为主,并发症以无菌性脑膜炎、非脑干脑炎和脑干脑炎为主。EV71是重症及死亡病例的重要病原构成。确诊的及时性以及并发症类型对于治疗结果具有重要影响