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利用微阵列芯片技术探究基因FOXQ1与大肠癌的关系

Exploring relationship between FOXQ1 gene and colorectal cancer using microarray technology

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文献详情

资源类型：
作者：
郑极[1,2] * ; 唐慧[3] ; 白璇[1,2] ; 岳柯琳[1,2] ; 郭强[1,2,*1] ;
机构： [1]云南省第一人民医院(昆明理工大学附属医院)消化内科 云南省昆明市650032 [2]昆明理工大学医学院 云南省昆明市650032 [3]云南省第一人民医院(昆明理工大学附属医院)临床基础医学研究所 云南省昆明市650032
出处：
DOI： 10.11569/wcjd.v24.i6.915
ISSN：

关键词： FOXQ1 癌基因 全基因组表达谱芯片 MicroRNA芯片

摘要：
目的:应用全基因组表达谱芯片和microRNA芯片检测人结肠癌细胞DLD1在敲低FOXQ1基因前后mRNA和microRNA的表达改变.方法:抽提两组细胞的RNA,分别与WholeHuman Genome Oligo Microarray(4×44 K,Agilent Technologies)全基因组表达谱芯片和mi RCURYTM LNA Array(v.18.0,AgilentTechnologies)microRNA芯片进行杂交,应用genespring、genepix软件对芯片结果进行统计,对全基因组表达谱芯片进行GO、pathway分析,并应用qRT-PCR对部分结果进行验证.应用Microsoft Excel和SPSS17.0软件进行统计学分析.结果:全基因组表达谱的检测结果表明,敲低FOXQ1基因后,在芯片所涵盖的41093个基因中,共有255个基因上调,176个基因下调.qRT-PCR的验证结果与全基因组表达谱芯片的结果基本相符.MicroRNA芯片的检测结果表明,敲低FOXQ1基因后,共有31个microRNA上调,12个microRNA下调.结论:本研究了解了FOXQ1基因敲低前后mRNA和microRNA的表达改变,为后续FOXQ1在结肠癌的发生发展中的作用机制研究提供了重要的线索和实验依据.

基金：
国家自然科学基金资助项目,Nos.81260323,81502556 云南省科技厅-昆明医科大学联合基金资助项目,Nos.2012FB095,2014FB088 云南省中青年学术技术带头人后备人才培养基金资助项目,No.2013HB083 云南省卫生厅基金资助项目,No.2014N272 National Natural Science Foundation of China,Nos.81260323 and 81502556%Science and Technology Department of Yunnan Province-Kunming Medical University Joint Foundation,Nos.2012FB095 and 2014FB088%Young Academic Talents Cultivation Foundation of Yunnan Province,No.2013HB083%the Foundation of Health and Family Planning Commission of Yunnan Province,No.2014N272
语种：
中文
第一作者：
第一作者机构： [1]云南省第一人民医院(昆明理工大学附属医院)消化内科 云南省昆明市650032 [2]昆明理工大学医学院 云南省昆明市650032
通讯作者：
通讯机构： [1]云南省第一人民医院(昆明理工大学附属医院)消化内科 云南省昆明市650032 [2]昆明理工大学医学院 云南省昆明市650032 [*1]650032,云南省昆明市金碧路157号,云南省第-人民医院(昆明理工大学附属医院)消化内科
推荐引用方式(GB/T 7714)：
郑极,唐慧,白璇,等.利用微阵列芯片技术探究基因FOXQ1与大肠癌的关系[J].世界华人消化杂志.2016,24(06):915-922.

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