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云南省2006年HIV-1流行毒株的基因测定和亚型分析

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资源类型:
机构: [1]云南大学生命科学学院生物化学与分子生物学系,昆明65009 [2]云南大学毒品综合研究中心,昆明65009 [3]云南省第一人民医院/昆明医学院附属昆华医院,昆明650032
出处:

关键词: HIV-1 蛋白质亚型 基因 云南

摘要:
目的为 了研究在中国云南流行的艾滋病毒I型(HIV-1)流行毒株的亚型类型与变异 特征,进行分子流行病学研究,为艾滋病预防控制工作提供参考。方法血浆来源于 云南省监测系统 中的19 例HIV-1感染者。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法,从19例患者血清中扩增HIV-] pol-gag共同拥有区片段并直接进行序列测定,所得序列用BioEdit和Mega软件进行亚型及系统发 生树分析。结果19 例标本结果显示,12例为CRF08- BC.3例为CRF07-BC.1例为B型、3例为 CRF01-AE型。19例毒株间的基因离散率都比较小,CRF08-BC亚型毒株间的基因离散率为2.45%, CRF07-BC亚型毒株间的基因离散率为2.16%;B亚型毒株为5. 00%;CRF01-AE亚型毒株与来自泰 国的流行CRF01-AE毒株AB032741.U51189的基因离散率分别为3. 12%、3.22%。结论.上 述结 果表明,云南地区CRF-BC重组亚型已成为HIV-1流行病学优势亚型,结果基本上反映了我国HIV- 1分子流行病学现状。

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第一作者:
第一作者机构: [1]云南大学生命科学学院生物化学与分子生物学系,昆明65009
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