目的:解析云南省埃可病毒30型（ECHO30）分离株的基因特征和遗传进化规律。方法:对云南省手足口病病原监测核酸阳性样本进行病毒分离，并进行VP1基因测序，利用MEGA 5.0软件对云南省8株ECHO30分离株和GenBank下载的ECHO30参考株VP1区基因序列进行比对分析，构建系统进化树，测算分离毒株核苷酸和氨基酸的同源性。结果:云南省ECHO30分布在文山州、曲靖市、楚雄市和昆明市，文山州分布比较普遍。云南省ECHO30分离株均属于H基因型的H2亚型，和云南省本土参考株LC120939遗传距离较近，VP1基因在在5位点，氨基酸变化比较活跃，氨基酸多样，54、156、258等位点也发生了突变。核苷酸和氨基酸同源性分别为84.0%~100.0%、98.4%~100.0%。结论:云南省ECHO30分离株具有一定的地理特征，均属于H基因型H2亚型，各亚型间毒株序列核苷酸差异性较小，亲缘性较近。