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云南省四株霍乱弧菌全基因组测序分析

Complete genomic sequences of four Vibrio cholerae in Yunnan Province

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]云南省第一人民医院呼吸内科,云南昆明650022 [2]云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所
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关键词: 霍乱弧菌 全基因组序列 云南

摘要:
目的 选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料. 方法 根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲场凝胶电泳带型特点等,选取了四株代表性霍乱弧菌,采用WGS Illumina HiSeq2500进行paired-end测序.对测序结果进行拼接、组装以及注释等. 结果 基因预测和功能注释结果显示,所有四株霍乱弧菌(YN2011004、YN98296、YN97083和YN89004)均显示携带有2个染色体,同时YN2011004,YN98296和YN89004各自携带有一个质粒.YN2011004的1号染色体具有2727个基因,2号染色体具有958个基因;YN98296 1号染色体具有2 825个基因,2号染色体具有969个基因;YN97083 1号染色体具有1948个基因,2号染色体具有955个基因;YN89004 1号染色体具有2653个基因,2号染色体具有907个基因.所有预测的基因功能主要涉及细菌生理代谢、信号储存和处理以及信号转导等各个方面. 结论 云南省的四株代表性霍乱菌株均具有两个染色体,其中三个菌株还各自含有1个质粒.

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第一作者:
第一作者机构: [1]云南省第一人民医院呼吸内科,云南昆明650022
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推荐引用方式(GB/T 7714):

资源点击量:82494 今日访问量:0 总访问量:681 更新日期:2025-01-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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