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内质网应激相关2型糖尿病关键基因免疫浸润及基因-药物网络建立

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资源类型:
机构: [1]云南省第一人民医院/ 昆明理工大学附属医院,老年医学科,云南 昆明 650000 [2]昆明市儿童医院/ 昆明医科大学附属儿童医院,新生儿科,云南 昆明 650000
出处:
ISSN:

关键词: 2型糖尿病 内质网应激 免疫浸润 生物信息学分析

摘要:
目的 基于内质网应激(ERS)相关2型糖尿病(T2DM)关键基因中探索免疫浸润及靶向药物治疗.方法 通过GSE9006数据集分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)及特征基因筛选获得3个ERS相关2型糖尿病(T2DM)关键基因(PTGS2、MPPE1和MOSPD2).利用CIBERSORT算法(version 1.03)及免疫细胞LM22基因集研究疾病和正常组免疫细胞差异并进行相关性分析.通过CTD(http://ctdbase.org/)检索3个关键基因的靶向药物,并在Cytoscape中构建基因-药物网络.结果 本研究得到的3个关键基因的表达水平在T2DM中均显著升高.免疫浸润分析发现,T2DM组嗜酸性粒细胞、激活的肥大细胞比例较高,CD8+T细胞、M2巨噬细胞浸润较低.这些结果表明这4种免疫细胞在T2DM中可能起着重要作用.不同免疫细胞之间的相关性分析显示,4种免疫细胞在T2DM中可能起着重要作用.PTGS2、MOSPD2和MPPE1基因分别有745个、25个和22个化学物质被鉴定并可视化.结论 在T2DM中,ERS相关特征与免疫浸润之间存在相互作用.本文也预测了与3个关键基因相关的药物.上述研究或可为未来T2DM的诊治提供重要参考依据.

基金:

基金编号: 202102AA310069

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]云南省第一人民医院/ 昆明理工大学附属医院,老年医学科,云南 昆明 650000
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):

资源点击量:82487 今日访问量:0 总访问量:681 更新日期:2025-01-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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