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血清mir-1307-5p在乳腺癌中的临床意义及生物信息学分析

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资源类型:
机构: [1]潍坊市人民医院乳甲外科,山东潍坊261041 [2]昆明理工大学临床医学院 [3]潍坊医学院医学检验学院
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关键词: 乳腺肿瘤 miR⁃1307⁃5p 靶基因 生物信息学

摘要:
目的 探讨miR-1307-5p在乳腺癌(BC)的表达及对乳腺癌发生发展的影响,评估其作为诊治的血清生物标志物的依据。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载乳腺癌的癌组织及癌旁组织miRNA表达数据,筛选差异表达miRNA。利用TargetScan, miRWalk, miRDIP数据库预测靶基因,并进行GO功能和KEGG信号通路分析。STRING在线软件分析蛋白之间的相互作用;Cytoscape软件筛选关键基因。利用TIMER数据库分析肿瘤组织和正常组织中关键基因的表达水平、关键基因表达水平与肿瘤浸润免疫细胞的相关性。通过受试者工作特征(ROC)曲线评估miRNA的诊断效能。结果 共发现158个差异表达miRNA,其中miR-1307-5p差异最明显(log FC>3),其靶基因功能富集于细胞内信号转导、大分子修饰、细胞蛋白修饰、蛋白质修饰等生物学过程。KEGG通路分析显示,miR-1307-5p显著富集在cGMP-PKG,NF-κB,VEGF等癌症相关信号转导通路。蛋白互作网络筛选得到5个关键基因:LYN,PRKCE,DICER1,PIP5K1C和MAPK13。这5个关键基因在乳腺癌组织及邻近组织中异常表达,差异均有统计学意义。乳腺癌中LYN表达与肿瘤浸润性免疫细胞相关。miR-1307-5p在乳腺癌患者血清中的表达水平明显升高(P<0.01),且与淋巴结转移密切相关(P<0.01),而与年龄、肿瘤大小、分期等无关(P>0.05)。miR-1307-5p水平诊断乳腺癌的AUC为0.904,灵敏度为0.90,特异度为0.76,其诊断效能优于传统肿瘤标志物。结论 miR-1307-5p可能通过靶基因参与相关信号通路,在乳腺癌的发生发展中发挥重要作用。它在乳腺癌中高表达且与淋巴结转移密切相关,有望成为乳腺癌诊治的生物标志物。

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第一作者机构: [1]潍坊市人民医院乳甲外科,山东潍坊261041
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