资源类型:
文章类型:
机构:
[1]昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系, 云南昆明650500
[2]中国科学院昆明动物研究所, 云南昆明650201
[3]云南省第一人民医院普外一科, 云南昆明650034
外科片
普外一科
云南省第一人民医院
出处:
ISSN:
关键词:
肝细胞癌
肿瘤突变负荷
分子预后模型
生物信息学
摘要:
为探讨肿瘤突变负荷(tumor mutation burden, TMB)对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)患者预后的影响,从the Cancer Genome Atlas数据库下载357例HCC样本进行生物信息学分析.结果显示:在HCC患者中,C>T变异、错义突变及TP53基因突变频率最高;TMB与患者预后呈负相关(P<0.05).功能分析表明,差异基因富集于细胞外基质组织形成和硫化合物代谢途径(P<0.05).基于SFRP4、IL7R、FBLN2、COLEC10和CHGA基因,构建了HCC预后预测模型.结果表明,高危组患者1年、3年和5年预后较差(P<0.001).
基金:
国家自然科学基金地区科学基金资助项目(82160533);;云南省科技厅-昆明医科大学应用基础研究联合专项资金资助项目(2019FE001-016);
第一作者:
第一作者机构:
[1]昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系, 云南昆明650500
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
李青玲,李树德,卫小娟,等.基于生物信息学的肝细胞癌预后模型的构建[J].昆明学院学报.2022,44(06):64-72.