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基于生物信息学的肝细胞癌预后模型的构建

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资源类型:
机构: [1]昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系, 云南昆明650500 [2]中国科学院昆明动物研究所, 云南昆明650201 [3]云南省第一人民医院普外一科, 云南昆明650034
出处:
ISSN:

关键词: 肝细胞癌 肿瘤突变负荷 分子预后模型 生物信息学

摘要:
为探讨肿瘤突变负荷(tumor mutation burden, TMB)对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)患者预后的影响,从the Cancer Genome Atlas数据库下载357例HCC样本进行生物信息学分析.结果显示:在HCC患者中,C>T变异、错义突变及TP53基因突变频率最高;TMB与患者预后呈负相关(P<0.05).功能分析表明,差异基因富集于细胞外基质组织形成和硫化合物代谢途径(P<0.05).基于SFRP4、IL7R、FBLN2、COLEC10和CHGA基因,构建了HCC预后预测模型.结果表明,高危组患者1年、3年和5年预后较差(P<0.001).

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第一作者:
第一作者机构: [1]昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系, 云南昆明650500
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