目的 通过对一个房间隔缺损先证者的四代家系进行致病突变筛查，利用全外显子测序及Sanger测序等分析基因型和表型之间的关系。方法 回顾性分析在云南省第一人民医院心脏大血管外科就诊的1例房间隔缺损患儿的临床资料，并采用全外显子测序技术对患儿及其弟弟、母亲进行遗传学检测，结合生物信息学分析，寻找导致该家系致病的遗传学病因。同时，对在该家系中发现的尾型同源盒基因4（Caudal Homebox Gene,CDX4）基因变异，进行散发ASD患者及健康人群的筛查。结果 患儿心脏超声结果及术中所见符合ASD诊断。基因检测提示患儿存在CDX4基因c.C233T纯合变异，其母亲携带该基因的杂合变异，其弟弟携带该基因纯合变异。CDX4基因第1外显子第233号密码子由C突变为T（c.C233T），导致第78号氨基酸由脯氨酸变为亮氨酸（p.P78L）。在198例散发性房间隔缺损患者中，5例患者存在该基因变异，而265例健康人群中未发现该基因变异。采用Fischer精确检验分析发现CDX4基因c.C233T纯合变异与先天性心脏病相关（P=0.014）。结论 CDX4基因c.C233T（p.P78L）纯合突变很可能是该家系的致病变异。