目的:分析昆明地区婴幼儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）缺乏症的基因突变特点。方法:选取2018年1月1日至2020年12月31日在昆明市出生的15 533例（男7 994例，女7 539例）婴幼儿，年龄5（4，9）d，采用荧光定量法、多色熔解曲线分析法（MMCA）和Sanger测序对葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性和基因突变类型进行检测。采用微滴式数字PCR技术（ddPCR）对一例新发变异家系进行定量分析，确定家系成员体细胞突变嵌合比例，同时对新发变异进行蛋白结构模型分析和致病性预测。采用SPSS 26.0统计软件进行数据分析，不同性别间G6PD酶活性和基因突变阳性检出率采用χ 2检验，G6PD基因突变组间酶活性的比较采用单因素方差分析。 结果:15 533例婴幼儿中G6PD酶活性检出阳性143例（男129例，女14例），检出率为0.92%（143/15 533），男女检出率差异具有统计学意义（χ 2=96.76， P<0.001）。89例酶活性阳性患儿（男83例，女6例）接受了基因检测，MMCA法检出77例（男72例，女5例），12份阴性样本进一步行Sanger测序，检出突变6份，均为男性。83例基因突变者中半合子突变78例，纯合突变1例，杂合突变4例。共检出12种突变类型，以G6PD c.487G>A、c.1024C>T、c.1388G>A和c.1376G>T 4种突变类型最为常见，占全部突变类型的74.70%（62/83）。c.1376G>T的平均酶活性最低，与另外3种突变的平均酶活性相比，差异均有统计学意义（ P均<0.05）。检出一例G6PD c.242G>C新发变异男性患儿，预测为致病性变异。ddPCR证明患儿母亲为c.242G>C变异嵌合体，嵌合比例为6.66%。 结论:昆明地区G6PD缺乏症基因突变以c.487G>A为主，检出一例G6PD c.242G>C新发变异。ddPCR技术可辅助用于突变嵌合体比例检测。